생물정보학 (Bioinformatics)
과목개요: 현존하는 데이터베이스 중에 가장 큰 비중을 차지하는 것은 생물체에 대한 정보이다. 생물체의 유전정보, 이들 유전자가 코딩하는 단백질 정보, 그리고 이들 단백질에 의해 이루어지는 생화학적 대사경로에 대한 정보는 매우 다양하며, 게놈분석이 이루어진 이후 기하급수적으로 증가하고 있다. 이러한 정보들을 효율적으로 다룰 수 있는 방법들으로 많은 컴퓨터 프로그램들이 개발되고 있으며, 이미 많은 부분을 이들에 의존하고 있다. 따라서 이러한 프로그램들을 적절히 이용하는 능력은 생물학을 배우고 연구하는데 있어 매우 필수적인 요소가 되고 있다.
수업계획
주 |
수업내용 |
수업방법 |
강의자료 |
과제물 |
1 |
수업진행소개 |
웹강의 |
모든 결과는 파워포인트 파일로 정리하여 제출 |
|
2 |
Database 검색 I |
NCBI |
Bioinformatics
& Computational Biology 단백질
특성과 기능 |
|
3 |
Database 검색 II |
Expasy |
서열정보 수집 유전자, cDNA, ORF, protein (example) |
|
|
4 |
Database 검색 III |
sequence alignment |
|
|
5 |
유전자분석 I: 유전자 구조 |
GenScan |
유사서열 수집 animal, plant, microbes |
|
|
6 |
Database 검색 III |
S-W, Blast, Fasta |
||
7 |
유전자분석 II: 기능 분석 |
단백질 구조분석 |
||
8 |
중간시험 |
|
|
break |
|
9 |
단백질 구조 |
|
|
3D structure modelling |
10 |
Multiple alignment I |
|||
11 |
Multiple alignment II |
Genedoc reporting |
|
|
12 |
Phylogeny 분석 I |
tree construction |
||
13 |
단백질 분석 |
MW, pI |
|
수업자료 7
(powerpoint) |
14 |
단백질 구조분석 |
3D structure |
|
|
15 |
Future of Bioinformatics |
summary |
||
16 |
기말시험 |
|
|